5月15日，卫生部决定对四川受灾严重县的防疫工作实施分省包干办法，一个省包一个县。先期14支卫生防疫队共计144人5月15日到达灾区，与当地防疫人员一起有序开展卫生防疫工作。目前，四川灾区没有发生传染病流行和其他突发公共卫生事件。
　　国新办5月15日就抗震救灾医疗救援情况举行新闻发布会，国务院抗震救灾指挥部医疗防疫组组长、卫生部党组书记高强介绍，截至5月15日10时，医疗队出动急救车6107次，现场急救伤员23449人；四川境内的各类医院共收治伤员64040人（含重伤员12587人），灾区医疗机构还有4240张储备病床可供使用。
　　目前，中央财政已经拨款2亿元用于灾区受伤人员的应急救治，拨款2亿元用于采购应急药品和医用物资，拨款3000万元用于派遣医疗队的有关费用补助。
　　高强表示，卫生部门肩负两大任务：一是全力抢救伤员，减少人员伤亡；二是做好灾区防疫工作，严防传染病的流行。
　　5月12日晚，卫生部连夜调集700人的应急医疗救治队伍，在北京及周边地区调集10350单位血液、2万袋代血浆和急救医疗器械、药品等15吨，于5月13日同赴灾区。5月13日晚，卫生部紧急调集1000人的应急医疗队伍和504辆救护车，于5月14日分批到达灾区。5月14日晚，卫生部又组织3000人的应急医疗队伍，随时待命奔赴灾区。截至5月15日10时，卫生部共调集18个省（区、市）的1755名应急医疗卫生救援人员，组成190个医疗组在灾区开展医疗救援工作。
　　另外，各省（区、市）还自发组织1200多名医务人员到灾区开展医疗救援。加上解放军、武警、公安系统派出的医疗队，现有近5000名医务人员在灾区实施医疗救援。四川省已从省内调集5000多名医务、防疫和卫生监督人员到灾情严重的地区开展医疗救治、疾病预防控制和卫生监督工作。同时，卫生部还调集中国疾病预防控制中心的专业卫生防疫队抵达四川，指导卫生防疫工作。
　　据介绍，消毒药品供应不足是当前医疗救援一大难题。由于当前最紧急的任务是救治伤员，已经紧急调运的国家储备物资主要是一些应急的药品和医疗器械，而用于消毒防疫的药品不多，只有5000瓶。虽然各省市派遣到灾区参与卫生救援的医疗队自带了大量消毒用品，但还远远不够。
　　高强指出，卫生防疫是一个长时间的工作过程，今后还需要大量的卫生消毒用品。他建议，从事卫生、消毒、防疫产品生产的企业多生产一些安全、有效、价廉的产品，为支援灾区做贡献。
　　针对灾后的防疫工作，国家已派出一大批有经验、有技术、有能力的卫生防疫人员赶赴灾区进行疾病预防控制工作，确保大灾之后无大疫。高强说：“防止灾后的传染病流行和突发公共卫生事件是卫生防疫人员的重大责任，我们的目标是实现大灾之后无大疫。”